A perspectiva preventiva, o desenvolvimento de modelos clínicos que possam ser utilizados em diferentes situações de trabalho, principalmente a institucional, são princípios presentes nas pesquisas realizadas na Instituição, embora tenhamos linhas de pesquisa cujo assunto fundamental é a prevenção ou a instituição.
Tendo em vista o aprimoramento do projeto educacional e científico, enfocamos a rede de disciplinas oferecidas pelos nossos docentes, com a preocupação de mantermos uma maior integração entre elas e entre as linhas e projetos de pesquisas da Instituição.
Diversas pesquisas estão sendo realizadas na Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP). Todas elas fortalecem a FAMERP como produtora de ciência e consolidam nossa instituição como centro de referência no ensino médico do país.